Bei deinem Dokument ist aus irgendwelchen Gründen Option
version=… gesetzt, um – soweit möglich – auf Kompatibilität mit einer älteren KOMA-Script-Version zurück zu schalten. Die Warnung gibt darüber Auskunft, dass damit nicht in allen Fällen das Ziel erreicht werden kann.
Oft ist die tatsächliche Ursache, dass veraltete Optionen verwendet werden, vor deren Verwendung schon lange gewarnt wird. Die Warnung ist übrigens noch länger (hier einmal korrekt als Code aus der log-Datei kopiert, damit man sie besser lesen kann):
Class scrbook Warning: Switching back to an old KOMA-Script release does
(scrbook) not mean, that KOMA-Script is fully compatible with
(scrbook) the old release. If you need full compatibility
(scrbook) to an old KOMA-Script release, you should use that
(scrbook) old KOMA-Script release. However, in that case you
(scrbook) could also need old releases of other packages and
(scrbook) even of the LaTeX kernel.
(scrbook) You should also note, that the KOMA-Script developers
(scrbook) refuse support for documents using `version=first'.
(scrbook) We recommend to eliminate all deprecated options
(scrbook) and commands. We also recommend to not use option
(scrbook) `version', i.e., with other values than `last'.
Statt
version=first kann da auch ein anderer Wert stehen, je nachdem welcher Wert verwendet wurde.
Eigentlich ist die Warnung also ziemlich klar und deutlich: Durch die Verwendung von Option
version (außer in der Form
version=last), lehnen die KOMA-Script-Entwickler (AFAIK ist das derzeit nur einer, nämlich Markus Kohm, also KOMA himself) jeglichen Support ab. Desweiteren wird noch einmal eindringlich empfohlen, alle verateten Optionen und Befehle durch aktuelle zu ersetzen.